В продажу поступает настольный расшифровщик генома

Размер и вес, как у большого принтера, а возможности — как у целой лаборатории. Новый аппарат впервые непосредственно переводит генетическую информацию в цифровой вид, минуя множество промежуточных шагов.

Теперь расшифровка генома какой-нибудь бактерии обойдётся учёным дешевле, чем с предыдущими методами, да ещё и займёт не дни или недели — а только пару часов. "Персональную геномную машину" (Personal Genome Machine) создала американская компания Ion Torrent.

В основе новинки лежит полупроводниковый чип, который в реальном времени измеряет концентрацию ионов водорода, производимых в ходе репликации ДНК.

Разумеется, перед отправкой образца на анализ его нужно заранее подготовить, для чего служит набор реактивов, поставляемых вместе с машиной и докупаемых по мере необходимости.

После того как машина записала последовательность ионных сигналов, та переправляется на сервер, который по оригинальному алгоритму конвертирует эту информацию в последовательность пар оснований и возвращает её в виде файла, пригодного для дальнейшего анализа рядом доступных программ.

Вопреки названию "персональная геномная машина" не предназначена для медицинской диагностики по ДНК людей или терапевтических целей. Её рынок (во всяком случае пока) — научно-исследовательские организации.

Компания Life Technologies, известная своими собственными технологиями секвенирования ДНК, минувшим летом купила Ion Torrent, расширив тем самым спектр предлагаемого биотехнологического оборудования. Life Technologies сообщает, что Personal Genome Machine стоит около $100 тысяч.

Аминокислоты найдены в невозможном месте

Девятнадцать различных аминокислот выявили исследователи в не совсем обычном метеорите, в котором по всем оценкам таких веществ быть не должно. Находка расширяет представления учёных о процессах, способных приводить к синтезу необходимых для жизни сложных соединений.

Речь идёт об астероиде 2008 TC3, который упал на Землю в 2008 году, взорвавшись в атмосфере и породив множество осколков (метеоритов), оперативно найденных в Нубийской пустыне.

Инициатор того поиска — Питер Дженнискенс (Peter Jenniskens), астроном из института по поиску внеземного разума (SETI Institute), – подтолкнул коллег к новой фазе работы. С его подачи специалисты из NASA и океанографического института Скриппса (Scripps Institution of Oceanography) провели анализ образцов 2008 TC3. (Кстати, на снимке под заголовком Питер слева, рядом с ним один из студентов, помогавших в поиске фрагментов астероида.)

Хотя содержание идентифицированных в кусочках метеорита аминокислот составило всего от 0,5 до 149 частей на миллиард, трудно переоценить важность открытия. Как объясняют исследователи в пресс-релизе центра Годдарда, ранее было установлено, что 2008 TC3 и сам является осколком – следом от столкновения в космосе двух астероидов (к слову, посмотрите на первую такую пойманную катастрофу). Минералы астероида рассказали, что породившее его тело некогда испытало нагрев до 1100 градусов по Цельсию.

Если бы в исходном объекте присутствовали аминокислоты, они, скорее всего, были бы уничтожены. Однако осколки самого 2008 TC3 демонстрируют эти "невозможные" молекулы. Об их космическом происхождении говорит пропорция — по 50% левых и правых аминокислот (жизнь на Земле использует только левые).

"Раньше мы думали, что существует простой способ производства аминокислот в астероиде при низких температурах в присутствии жидкой воды, – говорит Дэниел Главин (Daniel Glavin) из NASA, один из авторов исследования. – Этот метеорит предлагает другой способ, с участием реакций в газах, идущих по мере остывания горячего космического тела".

В свою очередь выходит, что аминокислоты в Almahata Sitta (так называются собранные фрагменты 2008 TC3) могли появиться в самом начале истории Солнечной системы.

Сложную органику, в том числе аминокислоты, учёные уже находили в метеоритах и кометах. Эти находки — аргумент в пользу космических корней жизни. По некоторым предположениям, если сама жизнь и не была занесена на Землю из космоса, то, возможно, космос подарил нам важные соединения, способствовавшие старту эволюции на нашей планете.